这首诗描绘了一位深谙兵法与文学的官员在小院中与友人探讨《周易》的情景。首联“小院金猊喷瑞芬，玄谈时自座前闻”以“金猊”象征高雅的香炉，散发出香气，营造出一种宁静而高雅的氛围，同时暗示主人的学识与品味。接着，“玄谈时自座前闻”则点明了他们在进行深入而高深的讨论。

颔联“运筹边计轻羊祜，落笔词锋逼子云”运用典故，将这位官员比作历史上的军事家羊祜和文学家扬雄（字子云），暗示他不仅在军事策略上有独到见解，且文采斐然，能够与古代的文豪相媲美。

颈联“万里江山瞻赤旆，百年心事共斯文”进一步展现了这位官员的胸怀与抱负，他以赤色的旗帜象征着对国家的忠诚与对胜利的渴望，同时也表达了他对历史与文化的深厚情感，以及与友人共同追求理想的心愿。

尾联“都门夜雨论周易，应憾伊川止七分”则以夜雨中的《周易》讨论为场景，暗含对古代哲学家程颐（字伊川）的敬仰，同时也表达了对未能达到更高境界的遗憾，体现了诗人对知识追求的执着与谦逊。

整体而言，这首诗通过细腻的描写与丰富的典故，展现了明代官员在学术与文化领域内的高深造诣及高尚情操，同时也流露出对历史先贤的敬仰与自我反思的精神。