这首诗描绘了诗人穿越石涧、攀登松岭，最终到达庆云禅院的旅程。通过生动的自然景观描写，展现了诗人内心的净化与升华。

首联“涧底流波石有声，岭边松向碧空鸣”，以动听的自然音响开始，溪水在岩石间潺潺流淌，发出悦耳的声音；而高耸的松树则在蓝天白云下轻轻摇曳，似乎在吟唱着大自然的赞歌。这两句通过声音的描绘，营造出一种宁静而又充满生机的氛围。

颔联“山云忽露法身净，花雨乍来尘想清”，进一步深化了主题。山间的云雾突然散开，仿佛揭示了佛家所说的清净法身；而花瓣如雨般飘落，似乎洗涤了心中的尘埃，让心灵得到了净化。这里不仅描绘了自然界的美丽景象，更寓意着精神层面的提升与解脱。

颈联“径路辟时开梵寺，峰峦环处列严城”，描述了诗人沿着开辟的道路，终于来到了庄严的寺庙和环绕的城池。这不仅是对物理空间的描述，也象征着心灵之旅的终点，即精神上的归宿与安顿。

尾联“青莲一朵悬千仞，撤手何期顶上行”，以“青莲”为喻，象征着高洁与纯净。一朵青莲悬挂在千仞之巅，既是对自然美景的赞美，也是对理想境界的追求。最后一句“撤手何期顶上行”，表达了诗人对超越自我、达到精神高峰的渴望与决心。

整体来看，这首诗通过细腻的自然描写，展现了诗人从物质世界到精神世界的深刻转变，以及对美好、纯净生活的向往与追求。