这首诗描绘了一幅宁静而幽深的山林画卷。首联“枕流亭子碧山围，石涧桥危过客稀”以“枕流亭子”为起点，描绘了亭子周围被碧绿的山峦环绕的景象，石涧上的危桥上行人稀少，营造出一种清幽静谧的氛围。颔联“流水落花春自老，湿云栖树晚犹飞”进一步渲染了季节的更迭与自然的循环，流水潺潺，落花飘零，春天似乎在自然的律动中悄然老去；而湿云依附于树梢，直至傍晚依然飞翔，展现出自然界生命力的顽强与和谐。

颈联“山人和露收松子，木客临池制芰衣”则将视角转向了山林中的隐士与动物，山人与自然和谐共处，收集松子，而木客（可能指某种林间生物）则在池边制作芰衣（菱衣），展现了人与自然的亲密关系以及生活的恬淡与自在。尾联“欲向丹崖同采药，黄精雨后渐应肥”表达了诗人对自然界的热爱与向往，想要与山林中的药材一同生长，期待雨后的黄精更加丰美，体现了对自然之美的追求与对生命力量的赞颂。

整体而言，这首诗通过细腻的景物描写和生动的人物活动，展现了明末文人对于自然美景的欣赏与赞美，同时也蕴含着对隐逸生活和人与自然和谐共生的美好愿景。