这首诗描绘了一位学者深夜独自读书的情景，充满了浓厚的学术氛围和对知识的渴望。首句“短檠深夜一船虚”以“短檠”（简陋的灯）和“一船虚”（空荡荡的船只）营造出一种孤寂而专注的夜晚读书场景。接着，“三尺藜床几卷书”进一步强调了环境的简朴与读书的专注，暗示了诗人对知识的追求超越了物质的享受。

“枕外坐闻心慰我，波中出听喜知鱼”两句，通过听闻外界的声音来表达内心的满足与喜悦，无论是枕边的静思还是波中的鱼声，都成为心灵的慰藉。这里不仅体现了诗人对自然之美的欣赏，也反映了他对内心世界的深刻洞察。

“政求入处门墙是，岂乞人间富贵馀”表达了诗人对于学问和道德修养的追求，认为真正的财富在于知识的积累和精神的富足，而非世俗的荣华富贵。这种超脱世俗的价值观，展现了诗人高尚的人格魅力和深邃的思想境界。

最后，“闻说天孙云锦好，大着心眼看何如”一句，以想象中的天孙（传说中的织女）所织的云锦之美，引申出对美好事物的向往和探索之心。这里的“大着心眼”，既是对广阔世界的好奇与探索，也是对内心世界不断追求和拓展的象征。

整体而言，这首诗通过对深夜读书情景的细腻描绘，展现了诗人对知识的热爱、对精神世界的追求以及对美好事物的向往，充满了浓郁的哲学思考和人文关怀。