这首诗描绘了一幅静谧而超凡脱俗的山中禅寺景象。首句“石门闭空翠”以石门隐于一片深绿色的自然之中开篇，营造出一种幽静深远的氛围。接着，“中有释子居”点明此处是僧侣修行之所，进一步强化了禅宗与自然和谐共存的主题。

“藤萝蔽白日，化景人世殊”两句，通过藤蔓和花朵遮蔽阳光，暗示了外界世界的喧嚣与这里的宁静形成鲜明对比，强调了遁入佛门后的超然物外之感。接下来，“真僧坐何年，膝下穿黄芦”描绘了一位高僧长年累月在此修行，甚至在膝下都穿出了黄芦，形象地表现了僧人的坚定与执着。

“劫灰几轮变，悟此因地初”则表达了时间的流逝与生命的无常，但通过修行，僧人能够洞察宇宙的真理，回归最初的本心。最后，“茫茫圆镜中，一脱尘垢污”用圆镜比喻，象征着通过修行，心灵得以净化，摆脱了世俗的束缚与污染。

“斯门尚可入，余亦当结庐”表达了诗人对这种生活状态的向往，希望也能加入其中，体验那份超脱与宁静。整首诗通过对山中禅寺的描绘，展现了佛教修行的意境与哲理，以及诗人对此的深深共鸣与向往。