这首诗描绘了净名院的清幽与宁静之美。诗人以“杖锡穷危顶，茅庵构白云”开篇，生动地勾勒出净名院所在之地的险峻与高远，仿佛与世隔绝，隐匿于云雾之中。接着，“轩窗半峰出，钟磬别山闻”两句，进一步渲染了院落的静谧氛围，轩窗半掩，仿佛与周围的山峰相接，而远处传来悠扬的钟磬声，似乎在诉说着超凡脱俗的禅意。

“海月晓同色，炉烟昼杂薰”则将时间推至清晨，海上的月亮与天空的颜色融为一体，晨光中缭绕的炉烟与日间的香气交织在一起，营造出一种超然物外的意境。最后，“莫教深静处，思虑落尘氛”提醒读者，在这样的环境中，心灵不应被世俗的杂念所侵扰，而是要保持纯净与宁静，让思绪得以净化。

整体而言，这首诗通过细腻的笔触和丰富的意象，展现了净名院作为修行之所的独特魅力，以及其对人心灵的净化作用，是一首富有哲理意味的佳作。