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性别生物钟，是指男性生物钟和女性生物钟会存在差别的现象。
具体来讲就是女性生物钟一个昼夜周期平均比男性的短6分钟。同时日照等因素会放大两性生物钟的差异，没有哪个人的生物钟周期正好是24小时，人们每天都要调节自己的生物钟。
研究发现，女性生物钟一个昼夜周期平均比男性短6分钟，女性失眠比男性多以及女性更倾向早睡早起可能与两性生物钟差异相关。研究人员说明，6分钟似乎不长，但是累积效果可观，好像一块手表一天快6分钟，如果长时间不调校，就会大幅偏离标准时间。
实验
美国哈佛大学医学院研究员珍妮·达菲等人让105名男性和52名女性参与睡眠实验。实验对象年龄在18岁至74岁之间。这些人按要求在波士顿一个睡眠实验室住一个月左右。实验室没有窗户，照明幽暗，让他们无法知道时间，以便研究人员观察他们在自身生物钟控制下的作息。
研究人员经由测量实验对象体温和褪黑激素水平，得知他们的生物钟周期。发现女性生物钟一个昼夜长度平均比男性短6分钟，实验对象生物钟周期平均值非常接近24小时。大约35%女性生物钟周期不到24小时，男性这一比例是14%。研究人员说，日照等因素会放大两性生物钟差异，没有哪个人的生物钟周期正好是24小时，人们每天都要调节自己的生物钟。
女性失眠情况比男性多50%。研究人员认为，这与女性生物钟周期短或有潜在关联。
建议
如果一个人的生物钟周期不到24小时，可增加晚间照明，宜在卧室窗户挂遮光帘，尽可能减弱早晨的太阳光线;若生物钟周期超过24小时，做法刚好相反，以适当缩短这一周期。