这首诗描绘了一幅静谧而深邃的山中古寺景象，诗人郭谏臣以细腻的笔触向碧峰上人表达敬意。"古刹深山里，幽栖独旻公"，开篇便营造出一种远离尘嚣的清修氛围，上人独自在高山古寺中修行，生活简静。"三乘闻己悟，五蕴本来空"，上人已领悟佛法的三乘教义，认识到世间万物的五蕴皆为空性，展现出其深厚的佛学造诣。

"止水禅心似，孤峰色相同"，将上人的禅定之心比作静止不动的水面，与孤峰的峻峭和寂静相映成趣，象征着内心的平静与超脱。"蒲团深岁月，龛外雨花红"，上人在蒲团上度过漫长的修行岁月，窗外的雨花红艳，反衬出内心的宁静和禅意的深远。

整体来看，这首诗赞美了碧峰上人深藏山中的修行生活，以及他对于佛法的深刻理解和实践，体现了明代文人士大夫对佛教禅修的崇尚和敬仰。