这首诗描绘了诗人邱云霄再次来到京城时的感慨与心境。首句“万里风尘剑独存”以剑象征坚韧不屈的志向，在历经万里风尘中依然独立，显示出诗人对自我品格的坚守。接着，“五云深处拜天阍”暗指进入朝廷，表达对权力中枢的敬意和期待。

“凡才自愧东方朔”借用东汉文学家东方朔的典故，自谦为平凡之才，流露出对自己才能的谦逊和对东方朔才华的仰慕。诗人感叹自己虽有才情，却只能在等待诏命的闲暇时光里怀念金马门（汉代官署名）的辉煌。

“鬓发已非前日月”通过描绘头发的变化，暗示岁月流转，表达了诗人对时光流逝的感慨。接下来，“蓬瀛真是别乾坤”借蓬莱仙境比喻京城，强调京城与外界的不同，暗示京城的繁华与壮丽。

最后两句“九溪蓑笠閒矶钓，流水桃花怅旧源”以渔夫垂钓的生活画面收尾，诗人身在京城，心中却怀念起往昔的自然生活，流露出对过去的追忆和对现世的淡淡惆怅。

整体来看，这首诗情感深沉，既有对个人命运的感慨，又有对京城生活的独特体验，展现了诗人丰富的内心世界。