这首诗描绘了夜晚在灵洲泊船时所见的宁静与神秘景象。首联“宝鹫何年寺，金山拥化城”以“宝鹫”和“金山”为引子，仿佛带人穿越到一个古老而神秘的佛教圣地，暗示着历史的深远与文化的积淀。接着，“窥禅双鸽下，傍佛一灯清”则通过双鸽窥禅的细节，营造出一种超脱尘世、心灵纯净的氛围，一盏佛前之灯，更添了几分庄严与神圣。

“水冷鱼龙寂，林寒鸟鹊惊”两句，通过水、鱼、龙、林、鸟、鹊的动态与静态结合，展现了夜晚自然界的寂静与生机，同时也暗示了诗人内心的平静与警觉。最后，“晓钟醒客梦，行矣谒承明”以晨钟唤醒沉睡的旅人，预示着新的一天即将开始，诗人将踏上新的旅程，前往“承明”，这可能是朝廷或象征着知识与智慧的所在，寓意着对未来的期待与追求。

整体而言，这首诗通过对自然景物的细腻描绘，以及对内心情感的微妙捕捉，展现了诗人对宁静、和谐与智慧的向往，以及对人生旅途的深刻思考。