这首诗描绘了中秋之夜在舟中的独特景致与情感体验。首联“遥空万里净埃氛，几度菰芦起雁群”以广阔的天空和远处的芦苇荡为背景，雁群的飞过增添了季节的气息，营造出一种宁静而深远的氛围。颔联“海上月华原自别，夜深秋色已平分”将月光与秋色巧妙结合，强调了月色的独特之美以及时间的流转，暗示着夜晚的深沉与季节的更迭。

颈联“素娥秘殿虚灵药，仙侣幽期隔彩云”运用神话元素，将月亮比喻为月宫中的仙女，隐喻着一种超凡脱俗的美好愿景，同时也表达了与理想中的美好相遇相隔的遗憾。尾联“此际清光人尽望，霓裳一曲许谁闻”则点明了此刻的月光成为众人共同瞩目的焦点，但那如同霓裳羽衣曲般的美妙乐章，却只能由少数人欣赏，暗含了一种对美好事物难以普及的感慨。

整体而言，这首诗通过细腻的描绘和丰富的象征手法，展现了中秋之夜的静谧与美丽，以及诗人对美好事物的向往与略带遗憾的情感表达，具有浓厚的文学韵味和审美价值。