这首诗描绘了南海神祠的壮丽景象与深厚的历史文化底蕴。首联“映庙波光色陆离，列朝典祀有崇碑”以“陆离”形容波光的斑斓色彩，展现出庙宇前水面的生动与美丽，同时点出神祠历经多个朝代的祭祀活动，留下了许多珍贵的碑刻，体现了历史的积淀与文化的传承。

颔联“乘槎人到潮偏满，行雨龙归气更奇”运用了两个典故，一是“乘槎”，指传说中的仙人乘木筏至天河，二是“行雨龙”，借指龙行雨时的壮观景象。这两句描绘了庙宇周围潮水满盈、龙行雨后的奇异气象，不仅增添了神秘色彩，也寓意着神祠的神圣与威严。

颈联“青琐望高游屐远，紫芝秋老带云垂”中，“青琐”常用来形容宫殿的门饰，这里借指庙宇的高大与庄严；“游屐远”则暗示了诗人对神祠的敬仰之情，即使远道而来也要一睹其风采；“紫芝秋老带云垂”则通过秋天的老紫芝和垂下的云彩，营造了一种深邃而肃穆的氛围，进一步烘托出神祠的庄重与神秘。

尾联“维舟片刻登临意，四百山灵已蚤期”表达了诗人短暂驻足后，心中对神祠的景仰之情，仿佛四百座山灵早已等候多时，等待着虔诚之人的到来。这一联既是对神祠的赞美，也是对诗人内心情感的抒发，展现了人与自然、人与神之间的一种和谐与共鸣。

整体而言，这首诗通过对南海神祠的细腻描绘，不仅展现了其独特的自然景观和深厚的文化底蕴，也表达了诗人对神灵的敬畏与崇敬之情，以及对美好精神世界的向往与追求。