这首诗描绘了南来祠水帝的壮丽景象，通过细腻的笔触展现了海市蜃楼的奇幻与神山的神秘。诗人以“南来祠水帝”开篇，巧妙地将祠堂与水神联系起来，赋予了自然景观以神圣色彩。接着，“光景动扶胥”一句，生动地描绘了阳光照耀下的水体波光粼粼，仿佛整个世界都被这光芒所激活，充满了生机与活力。

“海市空中起，神山水下居”两句，运用对比手法，一方面描述了海市蜃楼在天空中浮现的虚幻景象，另一方面则描绘了神山深藏于水下的神秘状态，两者相映成趣，既展现了自然界的奇妙，也暗示了超凡脱俗的精神追求。

“天浮元气外，地接大荒馀”进一步扩展了画面的广度和深度，将读者的视野引向了更广阔的天地，仿佛置身于宇宙的边缘，感受到了自然与宇宙的和谐统一。最后，“欲见仙人迹，章丘是石闾”表达了诗人对仙人踪迹的向往，同时也暗示了对理想境界的追求，体现了诗人超脱世俗、向往精神自由的哲学思考。

整体而言，这首诗通过对自然景观的描绘，不仅展现了诗人对美的追求，也蕴含了深刻的哲理思考，体现了明末清初文人对于自然与人文关系的独特见解。